長榮航空自2000年7月29日凌晨起所有航班均由二期航站起降，率先使用台灣桃園國際機場第二航廈，為台灣領空打造更宏觀的願景，並期使新航廈啟用後，搭乘長榮航空的旅客在步入航廈後便能享受本公司周到的優質服務，讓每一回搭乘長榮之旅都能盡善盡美。
 長榮航空桃園國際機場第二航廈出境服務3D導覽 : 繁體中文版 | 簡體中文版 - 新!
第二航廈本公司報到櫃檯為三樓出境大廳4、5、6、7、8號櫃檯，登機門分佈於機場之"C"側(C Wing)，"D"側(D Wing)，分別為C1-C10，及D1~D10號登機門，本公司航班多數停靠C1-C10及D6-D10，第二航廈的行李輸送設備係採全自動化之行李分揀系統，行李較第一航廈現行之人工分揀行李方式迅速精確。
第二航廈基本資料
| 啟用日期 |
2000年7月28日 |
| 樓層數 |
地面4層，地下2層 |
| 建物高度 |
47.3公尺 |
| 南候機廊廳總面積 |
208,000平方公尺 |
| 年容量 |
17,000,000人次 |
| 尖峰小時 |
5,000人次（入出境雙向） |
| 登機門 |
20個 |
| 客運機坪 |
20個 |
| 接駁機坪 |
7個 |
| 停車場胃納 |
小客車4,133輛，大巴士102輛 |
| 航空公司 |
長榮航空、立榮航空、全日空、美國航空、紐西蘭航空、加拿大國際航空、澳洲航空、新加坡航空、聯合航空 |
| 交通 |
聯外：捷運（尚未動工）、客運巴士、計程車、租車
航廈管制區：自動電車系統 (往返第一航廈與第二航廈) |
第二航廈樓面簡介
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樓層功能 |
主要空間規劃 |
| B2 |
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捷運系統車站、機械房 |
| B1 |
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行李處理室、餐廳、機械房、捷運系統川堂、室內停車場 |
| 1F |
入境層 |
入境行李提取大廳、海關行李檢查櫃台、迎客大廳、服務台、巴士等候休息室、旅館∕租車服務櫃台、醫療中心、航警∕海關辦公室、銀行、花店 |
| 2F |
入境夾層 |
入境走廊、入境證照查驗大廳、航站辦公室、航警∕境管∕海關辦公室、轉機休息室、銀行 |
| 3F |
出境層 |
出境報到大廳、出境證照查驗大廳、出境轉機休息大廳、一般商店區、免稅商店區、電視牆室、遊樂室、銀行、郵局、航警∕海關∕航空公司辦公室、出境走廊、候機室 |
| 4F |
出境夾層 |
航空公司貴賓室、中餐區、西餐區、商務中心、休息室、辦公室、旅館區 | |